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小鼠、血液、植物多样本直扩PCR

作者:上海魔兜儿生物科技有限公司 2025-05-27T00:00 (访问量:1752)

PCR-based Genotyping等实验,常需纯化样本基因组。当待测样本较多时,纯化基因组的过程费时、操作重复,并且实验成本高。 

直扩PCR直接从样本开始,以未经基因组纯化的微量原始样本或其裂解产物作为模板,进行PCR-based Genotyping。与常规PCR-based Genotyping相比,直扩样本用量少,操作简单,实验成本低,可高通量化样本检测。

图. Direct PCR技术

A. 直接法:取少量样本直接加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定。

B. 裂解法:样本取样后,加入裂解液中,裂解释放基因组,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,进行PCR鉴定。

 

技术优势   

♦ 直接:无需进行费时而昂贵的DNA纯化

♦ 快速:10min完成模板制备,最少50min完成PCR反应

♦ 简便:样品无需剪碎或研磨即可完成裂解;PCR Mix为预混液形式,减少加样步骤

♦ 节省:材料用量少

♦ 高通量:可在96孔板中完成裂解反应

 

直扩PCR试剂盒类型

产品参数

小鼠组织直扩试剂盒

血液直扩试剂盒

植物组织直扩试剂盒

适用生物

小鼠、大鼠

广泛生物

水稻、玉米、烟草、油菜、小麦、大豆等

适用组织/材料类型

鼠尾、鼠耳、脚趾(带肌肉)和其他脏器

含常规抗凝剂的新鲜血液、冷藏(冻)血液及Whatman903®和FTA®商用干血渍

嫩叶、老叶、幼苗、嫩茎

样品使用量

组织:5-10mg,鼠尾:1-5mm

最佳全血模板体积浓度范围为0.5%-20%,推荐使用量为10%作为初始尝试条件。对于贮存在Whatman®滤纸卡上的干血渍,则可取约1 mm2带血渍的圆纸片

叶片:1-10mm,种子:1-3mm

基因组释放时间

15min

无需

0-10min

PCR产物最适长度

<1kb

PCR产物是否加A

是,但裂解反应体系加A效率不定

20µL体系,裂解产物使用量

0.2-2µL

无需裂解

0.2-1µL

应用

转基因鉴定、基因分型等

 

实验过程 

本系列产品运用独特的蛋白酶裂解体系,裂解样品,裂解液可直接作为模板,搭配试剂盒中的PCR Master Mix进行基因扩增。

图. 小鼠组织直扩PCR实验过程

  

图. 植物组织直扩PCR实验过程

 产品性能

1、基因敲除小鼠基因型鉴定

图. 小鼠直扩PCR试剂盒检测基因敲除直扩结果

M:100bp DNA ladder。1-8以裂解产物为模板。+以50ng纯化基因组DNA为模板。﹣:以去离子水为模板。循环数:35个循环。

单条带(580bp):敲除动物纯合子基因组。单条带(180bp):野生型基因组。两条带(580bp/180bp):敲除动物杂合子基因组。

2、小鼠基因释放更快速、更充分

图. 小鼠组织直扩PCR试剂盒不同裂解时间直扩结果

M:100bp DNA ladder。+以50 ng纯化基因组DNA为模板。循环数:35个循环。

图. 鼠尾经不同裂解方式处理后的直扩结果。

检测基因:SOX21。M:100 bp DNA ladder。1-2以常规碱裂解方式处理裂解产物为模板。

3-4以小鼠组织直扩PCR试剂盒裂解产物为模板。+以50 ng纯化基因组DNA为模板。﹣:以去离子水为模板。循环数:35个循环。 

3、小鼠直扩表现优于竞品

图. 鼠尾经不同品牌同类产品裂解处理后的直扩结果

检测基因:SOX21。M :100 bp DNA ladder。以50 ng纯化基因组DNA为模板。循环数:35个循环。


4、多类型植物样本验证表现优异

图. 不同类型植物叶片直扩结果

M:100 bp DNA ladder。C相应植物纯化基因组DNA为模板。1-2叶片组织裂解产物为模板。循环数:30个循环。

 

5、多类型血液样本验证表现优异

图. 使用Positive control primer mix引物直接从不同物种、不同抗凝剂的全血及血卡中扩增237 bp的DNA片段。

血液模板浓度为10%,血卡模板为1 mm2大小。NTC为DEPC水作为模板,PC为提取纯化的人基因组DNA作为模板。1.人EDTA抗疑血(-20°C);2.小鼠EDTA抗凝血(新鲜);3.山羊EDTA抗凝血(-80℃);4.人血卡;5.人肝素抗疑血(-80°C);6.鸡肝素抗凝血(新鲜);7.猪柠檬酸钠抗疑血(4°C);8.NTC ;9.PC。

6、血液样本耐受性最高可达40%

图 含肝血抗凝血人血液直扩2kb、71%GC目的片段结果

血液模板浓度设置0.5-50%,延伸时间10 s/kb。

图 含EDTA抗凝血小鼠血液直扩2.2kb、67%GC目的片段结果

血液模板浓度设置0.5-50%,延伸时间10 s/kb。

 

客户反馈
1、北京客户:小鼠基因型鉴定效果优异

图. 使用Arcegen小鼠直扩PCR试剂盒进行小鼠基因型鉴定结果 

2、武汉客户:水稻基因直扩效果优异

图. 使用Arcegen植物直扩PCR试剂盒扩增水稻相关基因

3、上海客户:血液直扩PCR在竞品中表现优异。

图 使用Arcegen血液直扩PCR直接从人全血扩增不同长度DNA片段

血样为-20℃储存的EDTA抗凝血,血液模板浓度为10%,延伸时间10 s/kb。

237 bp;2. 150 bp (30%GC);3. 120 bp (75%GC);4. 2.1 kb (30%GC);5. 2 kb (71%GC);6. 4 kb (68%GC);7. 5 kb (65% GC);8. 8 kb (48% GC)

 

产品订购

产品应用

产品名称

货号

规格

目录价

直扩PCR,支持5重扩增,高GC兼容

Mouse Tissue Direct PCR Kit (With Dye)
小鼠组织直扩PCR试剂盒(含染料)

N132021E

50 T

300.00

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N132022E

20 T

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100 T

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植物直扩PCR试剂盒(含染料)

N132023E

50 T

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N132023S

200 T

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裂解液组分

Mouse Tissue/ Cell Lysis Reagent
小鼠组织/细胞裂解液

N132028E

50 T

125.00

N132028S

200 T

300.00

 

 

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产品名称

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含上样缓冲液,含5×loading buffer,可直接电泳,方便快捷;
极佳稳定性,室温6个月,-20℃1年。

1000bp DNA Ladder, 250-12000bp

N132116S

100 T

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50bp DNA Ladder, 50-1000bp

N132111S

100 T

110.00

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10×100 T

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100bp DNA Ladder, 100-1500bp

N132112S

100 T

110.00

N132112M

10× 100 T

990.00

100bp plus DNA Ladder, 100-3000bp

N132113S

100 T

110.00

N132113M

10×100 T

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200bp DNA Ladder, 200-5000bp

N132114S

100 T

110.00

N132114M

10×100 T

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500bp DNA Ladder, 500-5000bp

N132115S

100 T

110.00

N132115M

10×100 T

990.00

2000bp DNA Marker, 100-2000bp

N132117S

100 T

110.00

N132117M

10× 100 T

990.00

5000bp DNA Marker, 100-5000bp

N132118S

100 T

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10000bp DNA Marker, 100-10000bp

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100x1 mL

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15000bp DNA Marker, 250-15000bp

N132121S

100 T

110.00

N132121M

10× 100 T

990.00

 

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