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低dsRNA T7 RNA聚合酶突变体,助力降本增效

作者:苏州近岸蛋白质科技股份有限公司 2024-09-29T00:00 (访问量:7055)

多年来,T7 RNAP已广泛应用于原核生物和真核生物中的高水平基因表达,并在生物学其他领域的应用得到广泛扩展,例如RNA干扰、RNA编辑、合成基因电路、构建Vaccinia / T7混合系统等。

图1: T7 RNAP 在生物领域的多方面作用[1]

虽然T7 RNAP得到了广泛应用,但是,其作为体外RNA合成工具也存在一些不可忽略的缺点。T7 RNAP在合成RNA的过程中可能会产生许多的副产物,包括转录起始过程中产生的寡核苷酸、终止信号造成的中断RNA产物、依赖RNA的RNA聚合酶活性造成的3’末端延伸产物等。

因而,急需优化改进T7 RNAP,使其不仅能维持高效转录,同时也能够减少RNA产物不均一的问题。现在专利主要集中在以下方面: 通过改变特定位点氨基酸,提高T7 RNAP突变体的热稳定性或转录活力;通过提高转录温度,可以有效减少dsRNA的产生,但转录温度的提高同时,对生产工艺也提出了更高的要求;或通过定点突变T7 RNA聚合酶核苷酸序列增加酶的稳定性等。

基于T7 RNAP突变体的研究还在不断推陈出新。近岸蛋白推出新一代专利产品“T7 RNA聚合酶突变体”(专利号:ZL 2021 1 0044261.3,产品目录号:GMP-E122),经过上百个模板的验证,dsRNA产物在大多数模板上低于0.1ng/μg在修饰核苷模板上更是可以低于0.01ng/μg,相较于常规T7 RNA聚合酶,数量级降低dsRNA含量。

图2:突变T7酶大幅降低dsRNA含量

在过往的突变体中,往往强调了某一方面的性能,却伴随着其他性能的减弱。近岸蛋白新一代T7 RNAP突变体除显著降低dsRNA含量外,搭配特别优化的反应缓冲液(产品目录号:GMP-EB001),从产量(1μg模板可获得超过200μg RNA),到完整性(在不同质量模板下,完整性均可提高5-10%)以及加帽率(95-100%)等均维持较高的水平,属全能型选手

图3:数据展示

同时,随着自复制mRNA的研究越来越热,对于长片段转录的需求也越来越紧迫,传统T7 RNAP在长片段转录方面存在不可忽视的欠缺(完整性差、dsRNA含量高等)。

近岸蛋白新一代T7 RNA聚合酶突变体在自复制模板上同样展现出优异的性能。

图4:自复制saRNA完整性高

今年2月,Trilink帽结构专利在国内获批,本来成本占比就比较高的前提下,加之专利授权费用,双重压力下,无疑给mRNA药物研发及生产企业带来巨大的冲击。那么此时减少帽结构的用量无疑成为降低研发及生产成本的有效措施。为此,近岸蛋白特别设置从0.5mM-6mM帽结构投入量,分别搭载常规T7 RNA聚合酶和新一代T7 RNAP突变体进行转录反应,结果显示,帽结构使用量可以低至1mM,新一代T7 RNAP突变体在各个方面均表现出了优异的性能。

 

经过多种模板验证,近岸蛋白推出系列适合不同体系转录试剂盒,助力核酸药物快速开发:

货号 品名 描述
E331 T7 High Yield RNA Co-Transcription Kit for Reducing dsRNA Content 低dsRNA共转录试剂盒(含N1-Me-pUTP修饰碱基)
E332 T7 High Yield RNA Transcription Kit 2.0 低dsRNA转录试剂盒
E334 T7 High Yield RNA Transcription Kit 2.0(N1-Me-pUTP) 低dsRNA转录试剂盒(含N1-Me-pUTP修饰碱基)
E341 T7 High Yield RNA Transcription Kit for Long Fragment 适合大于6K以上长片段转录试剂盒

 

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[1] Borkotoky Subhomoi,Murali Ayaluru,The highly efficient T7 RNA polymerase: A wonder macromolecule in biological realm.[J] .Int J Biol Macromol, 2018, 118: 49-56.

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